Glossary entry

English term or phrase:

Expressed sequence tags

Russian translation:

метод учета маркерных экспрессирующихся последовательностей;

Added to glossary by Ann Nosova
Jun 10, 2005 11:33
19 yrs ago
2 viewers *
English term

Expressed sequence tags

English to Russian Science Genetics
Expressed sequence tags (ESTs) predicted to map to SSC13 on the basis of sequence similarity to genes and ESTs known to map to the homologous human chromosome (HSA3) were selected from our resource of porcine small intestine ESTs.
Proposed translations (Russian)
3 ***
3 +2 EST-последовательности
Change log

Jun 10, 2005 13:21: Elena Ivaniushina changed "Level" from "Non-PRO" to "PRO"

Votes to reclassify question as PRO/non-PRO:

PRO (2): Andrey Belousov (X), Volha K

When entering new questions, KudoZ askers are given an opportunity* to classify the difficulty of their questions as 'easy' or 'pro'. If you feel a question marked 'easy' should actually be marked 'pro', and if you have earned more than 20 KudoZ points, you can click the "Vote PRO" button to recommend that change.

How to tell the difference between "easy" and "pro" questions:

An easy question is one that any bilingual person would be able to answer correctly. (Or in the case of monolingual questions, an easy question is one that any native speaker of the language would be able to answer correctly.)

A pro question is anything else... in other words, any question that requires knowledge or skills that are specialized (even slightly).

Another way to think of the difficulty levels is this: an easy question is one that deals with everyday conversation. A pro question is anything else.

When deciding between easy and pro, err on the side of pro. Most questions will be pro.

* Note: non-member askers are not given the option of entering 'pro' questions; the only way for their questions to be classified as 'pro' is for a ProZ.com member or members to re-classify it.

Proposed translations

10 hrs
Selected

***

*** Случайно(произвольно)отобранные, неполные последовательности комплементарной ДНК, представляющие соответствующие информационные РНК (посредники,messengers)
Определение из глоссария (кстати, очень неплохой источник информации):


http://medic.ibmh.msk.su/bioinformatics/glossary.htm
Institute of Biomedical Chemistry (Moscow, Russia)
BIOINFORMATICS CENTER - "From Gene to Drug"

Expressed Sequence Tag (EST) Randomly selected, partial cDNA sequence; represents it's corresponding mRNA.
dbEST is a large database of ESTs at GenBank, NCBI.

cDNA- Complementary DNA; synthesized from a mRNA template
mRNA -Messenger RNA; an expressed gene that is then translated into a protein

http://www.pereplet.ru/obrazovanie/stsoros/91.html
Современные представления о роли ДНК в наследственности лучше всего отражает так называемая "Центральная догма" молекулярной биологии (рис. 1), сформулированная Фрэнсисом Криком [2]. Согласно Центральной догме в ДНК, способной к самовоспроизведению, закодирована первичная структура белков, то есть последовательность их аминокислотных остатков. Эта генетическая информация переносится с ДНК на РНК, которую в этом случае называют информационной - иРНК или мРНК (от англ. messenger - посланник, переносчик). Именно мРНК переносит информацию о структуре белков от ДНК хромосом, находящихся в ядре, в цитоплазму, где и происходит синтез белков.

Итак, ДНК через своего посредника (мРНК) определяет чередование аминокислот в белках. При этом соблюдаются правила генетического кода, суммированные в таблице.

--------------------------------------------------
Note added at 21 hrs 51 mins (2005-06-11 09:25:04 GMT)
--------------------------------------------------

Извините, отвлеклась, не сумела закончить. Названий несколько, они в чем-то похожи. Например:
метод экспрессирующихся ярлычков;
экспрессируемые ярлыки ;
метод учета маркерных экспрессирующихся последовательностей;
концы экспрессирующихся последовательностей ;
Можно встретить в тексте и просто не переведенное выражение, в середине статьи на русском языке, эти термины переводить не всегда просто.
*Именно секвенирование с больших объемов с-DNA последовательностей в виде библиотек expressed sequence tags (EST) различных организмов и даже целых геномов длиной...*
К сожалению, не могу компетентно сказать, какой перевод выбрать, решать будет автор вопроса. Вот ссылки по приведенным наименованиям данного выражения.

http://www.bionet.nsc.ru/chair/cib/lectures/2003_1_CompGenom...
Определим, что такое, собственно, Expressed Sequence Tags (ESTs) или «ИСТ». Это - это короткие (обычно около 300-500 bp), прочитанные за один раз (single-pass reads) фрагменты кДНК.
Они представляют собой «слепок», «отпечаток» (snapshot) с продуктов гена, проэкспрессированных в определенной ткани или на определенной стадии развития. Они являются метками (tags) экспрессии гена для определенной библиотеки кДНК
http://medicine.referat.ws/006829-49
Практически такое же число генов (64 000) определено недавно методом учета маркерных экспрессирующихся последовательностей (expressed sequence tags) (Fields et al., 1994) http://vivovoco.rsl.ru/VV/JOURNAL/VRAN/GENOMICS/GENOMICS.HTM
Анализ клонотек * интересен и сам по себе. В разных странах осуществляется несколько проектов по тотальному секвенированию мРНК человека, а значит, будет получена полная характеристика набора человеческих генов. Даже частичные результаты секвенирования, так называемые экспрессируемые ярлыки (Expressed Sequence Tags - EST), не только служат источником для идентификации генов, но и используются сами по себе, например, при изучении альтернативного сплайсинга.
http://www.rusmedserv.com/problreprod/1999/1/article_152.htm...
При этом они использовали метод, когда большинство полученных из библиотеки кДНК секвенируются. В этом случае могут получаться не полные последовательности генов, а только отдельные их участки (как бы «ярлычки», маркирующие эти гены), которые заносят в банк данных и по которым в дальнейшем можно будет идентифицировать эту последовательность, если она будет выделена из других источников. Отсюда этот метод получил название «метод экспрессирующихся ярлычков» – expressed sequence tags (ESTs). С помощью этого метода было идентифицировано шесть ESTs, два из которых соответствовали housekeeping генам (последовательности гена гексокиназы 1 и серин/треониновой фосфорилазы
http://www.jcbi.ru/obzor/obzor.php?id=138
Кроме хорошо известных генов в базу данных включены сотни тысяч новых концов экспрессирующихся последовательностей (EST - expressed sequence tags). Летом 1999 насчитывала более 75000 кластеров, представляющих более 75% всех человеческих генов. Служит для поиска генов в новых последовательностях, а также для определения реагентов при секвенировании генов и их экспрессии. http://dna.pynny.ru/russian/history.html
Другим, единственным успешным, направлением ДНК-чип технологии стал мониторинг генной экспрессии. Появление этого типа чипов также напрямую связано с успехами масштабных программ по геномному секвенированию. Именно секвенирование с больших объемов с-DNA последовательностей в виде библиотек expressed sequence tags (EST) различных организмов и даже целых геномов длиной измеряемой миллионами вр поставило перед исследователями задачу определения функционально значения полученной генетической информации в виде баз данных по первичной структуре обширных библиотек EST высших организмов и набора ORF в полностью секвенированных геномах. Это направление получило название функциональной геномики.
http://www.bionet.nsc.ru/vogis/vogis.php?razdel=print&paper=...
В настоящее время проект DOTS направлен на аннотирование последовательностей ДНК геномов мыши и человека, как наиболее полно представленных. Основой для БД DOTS являются:
экспериментально полученные последовательности мРНК;
так называемые последовательности EST (Expressed sequence tags) [3];
предсказанные гены – гены, выявленные с помощью компьютерного анализа.
Самыми многочисленными являются EST последовательности. EST, по сути, являются последовательностями разной длины (в среднем около 500 п.о.), полученными путем обратной транскрипции с 3’ конца мРНК последовательностей. Для общего пользования в настоящее время доступны порядка 2 млн таких последовательностей, из них 1,5 млн – человеческие, которые содержатся в специальной базе UNIGENE (http:// ncbi.nih.gov).


Something went wrong...
4 KudoZ points awarded for this answer. Comment: "Спасибо!"
+2
42 mins

EST-последовательности

EST последовательности автоматически сравниваются системой UniGene и группируются в кластеры по признакам.
Большое количество EST последовательностей идентифицировано институтом геномных исследований (TIGR), Institute for Genomic Research).
www.lytech.ru/Public/DNAdiagn/dna4.htm

--------------------------------------------------
Note added at 43 mins (2005-06-10 12:17:07 GMT)
--------------------------------------------------

This might help as well:
http://www.multitran.ru/c/m.exe?a=ForumReplies&MessNum=14552...

--------------------------------------------------
Note added at 51 mins (2005-06-10 12:24:43 GMT)
--------------------------------------------------

Сплайсинг происходит в ядре, трансляция – в цитоплазме. Для изучения того, что же оказалось в цитоплазме (то есть того, что подвергается трансляции), секвенируют короткие, 500-600 до 1000 нуклеотидов куски цитоплазматической РНК. Такие сиквенсы называются EST (expresstion sequence tag – \"ярлыки экспрессируемых последовательностей\"). EST – это короткие, прочитанные однократно (то есть весьма неточно), фрагменты цитоплазматической (сплайсированной, содержащей только экзоны) РНК. Если у нас есть геном, то мы можем эти EST картировать на геном и, тем самым, найти, где находятся интроны и экзоны.
http://fizhim.ru/student/files/biology/biolections/lection25...

Peer comment(s):

agree Volha K
47 mins
Thank you! :)
agree Natalie : метки, таги
1 day 6 hrs
Thank you! :)
Something went wrong...
Term search
  • All of ProZ.com
  • Term search
  • Jobs
  • Forums
  • Multiple search