Tissue microarray - это панель, которую собирают из образцов ткани, полученных из разных источников. Эти образцы (или микрообразцы - их диаметр может быть меньше 1 мм) и называют cores. Duplicate cores означает, что из каждой ткани в панель включали два образца. Можно сказать, что каждую ткань исследовали в двух повторностях.

--------------------------------------------------
Note added at 19 hrs (2014-07-19 14:43:41 GMT)
--------------------------------------------------

Core - это образец, а не повторность. В Вашем предложении - брали один образец нормальной слизистой и по три образца аденокарциномы (или образцы аденокарциномы в трех повторностях) для каждого пациента. Смотрите по контексту.